Delta variant: keys and questions about traffic in Argentina – Telam

Delta has been detected in 142 countries and 90% of sequenced cases that were reported in July worldwide.

Is there community circulation of the Delta variant of the coronavirus in Argentina? Why is your income so affected? Is the third wave coming? So many questions that have resonated this week since the confirmation of five cases with this worrying variant unrelated to travelers and which were answered by two of the specialists who know the most about the subject in the country.

First identified in India in October last year, the Delta variant – defined by the World Health Organization (WHO) as one of the four variants of concern – has been driving a new wave in various parts of the world due to its greater contagion capacity.

The Delta variant has been the engine of a new wave in various parts of the world due to its greater contagion capacity.“

In Argentina, there are two groups that perform genomic surveillance of the coronavirus, that is, they perform genetic sequencing of local samples of patients to determine which are the circulating variants: one is the ANLIS-Malbrn Institute and the other is Argentinian inter-institutional SARS-CoV-2 genomics project (COUNTRY).

This week, the Ministry of Health published a work done by the two in which they carried out the detection of five cases of residents of the city of Buenos Aires who had the Delta variant whose link to travelers had not been determined.

Meanwhile, on Friday, he reported that so far “there are 174 cases with sequenced Delta variant (travelers, linked to travelers and 5 unrelated cases), plus 21 positive COVID close contact cases from confirmed Delta variant cases. “

Dans ce contexte, la virologue Carolina Torres, membre du projet PAIS, et la biochimiste Josefina Campos, coordinatrice de la plateforme de génomique et bioinformatique ANLIS-Malbrn, ont expliqué à Tlam ce qu’impliquent ces détections et les variables qui interviennent pour réfléchir à différents futurs. scénarios liés à la pandémie en Argentine.

Tlam : Quelles sont les variantes qui circulent aujourd’hui dans le pays au niveau communautaire ?
Carolina Torres : Au niveau des pays, parmi les nouveaux cas, il y a une prédominance de la variante Gamma (identifiée pour la première fois à Manaus), sauf dans la zone métropolitaine de Buenos Aires (AMBA) où il y a une prévalence similaire entre Gamma et la variante définie par l’OMS comme d’intérêt Lambda (dite Andina).

En ce qui concerne le groupe Alpha (connu sous le nom de Royaume-Uni), certaines villes en ont encore mais on en voit très peu en Argentine.

“Dans la plupart des endroits où il est entré, il est rapidement devenu prédominant et cela est dû au fait qu’il a un indice de transmissibilité élevé qui a été démontré dans plusieurs études”“

Josefina Campos

T. : A partir des cas détectés avec Delta sans lien avec les voyageurs, peut-on dire qu’il y a une circulation communautaire ?

CT : Ce qu’implique la détection de ces cas, c’est qu’il y a des chaînes de transmission locales, mais on ne parle toujours pas de circulation communautaire car c’est un concept défini par le Ministère de la Santé de la Nation en tenant compte de plusieurs facteurs.

essentiellement Ce qu’il faut pour définir la « transmission communautaire », c’est qu’il existe un risque élevé de contracter cette variante au niveau communautaire..

Pour l’instant, ce sont des cas isolés ; les nouveaux rapports correspondent donc toujours aux variantes que nous avons mentionnées précédemment : Gamma et Lambda.

Il en est ainsi parce que les chaînes de transmission peuvent être coupées, et que tous les cas détectés sans lien avec un voyageur ne conduisent pas nécessairement à une circulation communautaire ; c’est une étape intermédiaire.

La détection de ces cas implique qu’il existe des chaînes de transmission locales, mais on ne parle toujours pas de circulation communautaire.

T. : Comment était le comportement de Delta dans les autres pays du monde ?

Josefina Campos : Delta a été détecté à ce jour dans 142 pays et un 90 pour cent des nouveaux cas séquencés qui ont été signalés en juillet dans le monde au GISAID (Initiative mondiale sur le partage de toutes les données sur la grippe – initiative mondiale pour partager les données sur les virus de la grippe -) correspond à cette variante.

Dans la plupart des endroits où il est entré, il est rapidement devenu prédominant et cela est dû à son indice de transmissibilité élevé qui a été démontré dans plusieurs études ; cela signifie qu’une personne en infecte plusieurs.

CT : Dans le monde entier, il a eu un comportement similaire dans les pays où il est entré. Ce qui s’est passé, c’est entre deux et quatre semaines de détections sporadiques et depuis qu’il est devenu entre 1 et 5% des détections, après un mois, il a dépassé 50% et en six à huit semaines, il est devenu 90% des nouveaux cas.

Cette plage de semaines est liée à la situation dans les pays où il est arrivé ; Par exemple, s’il s’agissait d’endroits où il y avait moins de restrictions, l’utilisation obligatoire des jugulaires avait été supprimée, des événements massifs avaient été activés ou il n’y avait aucun contrôle sur l’entrée dans le pays.

en outre Il a été observé que dans un premier temps, la variante est entrée dans la population non vaccinée et s’est ensuite propagée au reste..

Les spécialistes s’accordent sur l’importance d’avancer avec le Plan de vaccination pour faire face à la variante Delta.

T. : Que va-t-il se passer en Argentine ?

JC : Ce qui se passe dans le pays dépendra de multiples facteurs tels que l’interaction de Delta avec les autres variantes. Il faut savoir qu’en Argentine les prédominants sont Gamma et Lambda, pas Alpha comme c’est le cas au Royaume-Uni ou aux États-Unis.

Un autre facteur est, au cas où la circulation communautaire de Delta commence, dans quelle situation se trouve la population en ce qui concerne la vaccination et comment Delta répond aux vaccins qui sont dans le pays.

Et cela aura aussi à voir avec les mesures de santé publique qui sont prises et le comportement social, à la fois les soins généraux et le respect de l’isolement de ceux qui entrent de l’étranger.

“Nous devons avancer avec des calendriers de vaccination complets pour obtenir une plus grande protection contre cette variante et toutes les variantes qui peuvent survenir”“

Josefina Campos

CT : Concernant la façon dont il interagit avec d’autres variantes, le comportement que nous avons mentionné dans la réponse précédente s’est produit dans des populations à prédominance d’Alpha. En Afrique du Sud, qui avait une prédominance de la variante Beta, elle est aussi rapidement devenue prédominante.

Dans la plupart des pays d’Amérique du Sud, le gamma prédomine, sauf au Pérou (où le lambda prédomine) et en Colombie (avec une variante qui est surveillée).

Au Brésil, le Pérou, le Paraguay, la Colombie, le Chili et l’Équateur ont déjà signalé des cas sans lien avec les voyageurs. Et au Brésil précisément, où une circulation communautaire a été annoncée à Rio de Janeiro et à São Paulo, le Delta représente déjà 60% des nouveaux cas signalés.

« Si la campagne de vaccination parvient à compléter les calendriers d’un grand pourcentage de la population, même si Delta entre et que les infections augmentent, il est fort probable que nous aurons moins de cas graves et moins de décès »“

Image de balise Caroline Torres

T. : Une troisième vague est-elle inévitable ?

JC : Cela dépend de la façon dont tous les facteurs que nous avons mentionnés avant se rejoignent. Ce qui est important, c’est qu’il est nécessaire d’avancer avec les calendriers de vaccination complets pour obtenir une plus grande protection contre cette variante et toutes les variantes qui peuvent survenir ; ainsi que que les mesures de soins telles que l’utilisation correcte du masque, la ventilation et la distance soient maintenues, car cela dépend aussi de l’augmentation ou non des cas.

CT : Il est très difficile de prédire ce qui va se passer. Ce qui s’est passé jusqu’à présent, c’est que tôt ou tard le variant entre, mais son impact dépend de nombreux facteurs, dont la vaccination. Si la campagne de vaccination parvient à compléter les calendriers d’un grand pourcentage de la population, même si Delta entre et que les infections augmentent, il est fort probable que nous aurions moins de cas graves et moins de décès.