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Tout comme une carte du monde est plus qu'une liste de lieux et de noms de rues, le génome est plus qu'une chaîne de lettres. Une chorégraphie complexe de protéines et d'acides nucléiques interagissant différemment dans le temps dans l'ADN, les cellules peuvent ainsi gérer de manière sélective les informations génétiques au cours du développement et de la différenciation cellulaire ou en réponse à des aspects physiologiques et environnementaux.
Les scientifiques du monde entier développent de nouvelles technologies et progressent dans la compréhension de la dynamique de l'organisation tridimensionnelle du noyau. Cette nouvelle approche permettra aux chercheurs de cartographier les différences entre les types de cellules, d’explorer le fonctionnement réel de l’expression des gènes dans la santé ou la maladie, et de déterminer comment les fonctions de l’ADN sont réalisées, même si elles se trouvent dans un noyau minuscule.
"Nous savons que le repliement du génome et sa dynamique modulent l'expression des gènes et que les nouvelles technologies nous permettent de construire des modèles 3D pour étudier ces changements, ce qui bouleverse actuellement la recherche sur le génome et renforce notre compréhension de la complexité du noyau cellulaire", explique Marc A. Marti. Renom, professeur de recherche ICREA au Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) du Centre de régulation de la génomique (CRG) de Barcelone, en Espagne. "Il s'agit d'un domaine absolument prometteur et nous voudrions appeler à des normes, car le développement rapide des méthodes et la complexité croissante des données posent de nombreux défis qui doivent être résolus maintenant", a-t-il déclaré.
Dans un article en perspective publié dans le dernier numéro de Nature Genetics, des scientifiques de premier plan dans le domaine de la dynamique et de la génomique structurelle ont appelé à des normes en matière de génome 3D et de données épigénétiques. Ils décrivent les principaux défis dans ce domaine et fournissent des lignes directrices pour réfléchir aux stratégies de validation partagée standardisée des ensembles de données et des modèles de nucléomes 4D.
Ce document découle de leur expérience dans l’initiative 4D Nucleome Initiative dans le cadre de l’initiative LifeTime pour un nouveau FET-Flagship en Europe visant à comprendre le fonctionnement des génomes au sein des cellules, ainsi que la manière dont les cellules forment les tissus et remodèlent de manière dynamique leurs activités lorsque les tissus progressent vers la maladie.
Avec cet appel aux normes, des experts internationaux de l’Institut Curie à Paris, de l’Institut de génétique et de médecine moléculaire du MRC de l’Université d’Édimbourg, du Centre de biologie intégrative de l’Université de Toulouse, de l’Institut de génétique humaine de Montpellier, de l’Institut Babraham de Cambridge, Université d'État de Floride à Forida (États-Unis), Institut Friedrich Miescher de recherche biomédicale à Bâle, Université Napoli, Institut de santé de Berlin, Institut de recherche en biomédecine IRB Barcelona, Centre Max Delbruck de médecine moléculaire à Berlin , l'Institut d'épigénétique et des cellules souches Helmholtz Zentrum Muenchen à Munich, et le Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) du Centre de régulation de la génomique (CRG) de Barcelone, souhaitent que les informations soient correctement caractérisées, validées et partagées. et que les ressources sont utilisées efficacement.
Source de l'histoire:
Matériel fourni par Centre de régulation génomique. Remarque: le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.
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