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A very contagious SARS-CoV-2 variant was unknowingly spreading for months in the United States in October 2020, according to a new study by researchers at the University of Texas at Austin COVID-19[feminine Consortium de modélisation. Les scientifiques l’ont découvert pour la première fois au début de décembre au Royaume-Uni, où la variante hautement contagieuse et la plus mortelle serait originaire. Le journal Maladies infectieuses émergentes, qui a publié une version à diffusion anticipée de l’étude, fournit la preuve que la variante de coronavirus B117 (501Y) s’était répandue à travers le monde sans être détectée pendant des mois lorsque les scientifiques l’ont découverte.
«Au moment où nous avons appris l’existence de la variante britannique en décembre, elle se propageait déjà silencieusement à travers le monde», a déclaré Lauren Ancel Meyers, directrice du COVID-19 Modeling Consortium à l’Université du Texas à Austin et professeur de biologie intégrative. . «Nous estimons que la variante B117 est probablement arrivée aux États-Unis en octobre 2020, deux mois avant de savoir qu’elle existait.»
Une variante hautement contagieuse du SRAS-CoV-2 se propageait sans le savoir pendant des mois aux États-Unis en octobre 2020, selon une nouvelle étude menée par des chercheurs de l’Université du Texas à Austin COVID-19 Modeling Consortium. Crédit: Jenna Luecke / Université du Texas à Austin
En analysant les données de 15 pays, les chercheurs ont estimé la probabilité que les voyageurs du Royaume-Uni aient introduit la variante dans 15 pays entre le 22 septembre et le 7 décembre 2020. Ils ont constaté que la variante du virus était presque certainement arrivée dans les 15 pays à la mi-novembre. Aux États-Unis, la variante était probablement arrivée à la mi-octobre.
“Cette étude met en évidence l’importance de la surveillance en laboratoire”, a déclaré Meyers. «Un séquençage rapide et extensif des échantillons de virus est essentiel pour la détection précoce et le suivi des nouvelles variantes préoccupantes.»
Parallèlement à la publication de l’article, les membres du consortium ont développé un nouvel outil que les décideurs de partout aux États-Unis peuvent utiliser pour planifier le séquençage génétique qui aide à détecter la présence de variantes. Pour aider les États-Unis à étendre la surveillance nationale des variantes, le nouveau calculateur en ligne indique le nombre d’échantillons de virus qui doivent être séquencés afin de détecter les nouvelles variantes lorsqu’elles émergent pour la première fois. Par exemple, si l’objectif est de détecter une variante émergente au moment où elle provoque 1 nouvelle infection au COVID-19 sur 1000, environ 3000 échantillons positifs au SRAS-CoV-2 par semaine doivent être séquencés.
En analysant les données de 15 pays, les chercheurs ont estimé la probabilité que les voyageurs du Royaume-Uni aient introduit la variante dans 15 pays entre le 22 septembre et le 7 décembre 2020. Ils ont constaté que la variante de coronavirus B117 (501Y) était presque certainement arrivée dans les 15 pays. à la mi-novembre. Aux États-Unis, la variante était probablement arrivée à la mi-octobre. Crédit: Consortium de modélisation COVID-19 de l’Université du Texas
«Les responsables de la santé recherchent de meilleurs moyens de gérer l’imprévisibilité de ce virus et de ses futures variantes», a déclaré Spencer Woody, stagiaire postdoctoral au UT COVID-19 Modeling Consortium. «Notre nouveau calculateur détermine combien de spécimens positifs de SRAS-CoV-2 doivent être séquencés pour garantir que les nouvelles menaces sont identifiées dès qu’elles commencent à se propager.»
Il a expliqué que la calculatrice a une deuxième fonctionnalité. «Cela aide également les laboratoires à déterminer à quelle vitesse ils détecteront de nouvelles variantes, compte tenu de leur capacité de séquençage actuelle.»
«Nous avons créé cet outil pour aider les responsables de la santé fédéraux, étatiques et locaux à construire des systèmes d’alerte précoce crédibles pour cette menace de pandémie et les futures», a déclaré Meyers.
Des informations plus détaillées sur la calculatrice sont disponibles ici.
Référence: «Risque pour les importations internationales de la variante SRAS-CoV-2 originaire du Royaume-Uni» par Zhanwei Du1, Lin Wang1, Bingyi Yang, Sheikh Taslim Ali, Tim K. Tsang, Songwei Shan, Peng Wu, Eric HY Lau, Benjamin J. Cowling et Lauren Ancel Meyers, 24 mars 2021, Maladies infectieuses émergentes.
DOI: 10.3201/eid2705.210050
Outre Meyers, les auteurs de l’article sur les maladies infectieuses émergentes sont Zhanwei Du, Bingyi Yang, Sheikh Taslim Ali, Tim K. Tsang, Songwei Shan, Peng Wu, Eric HY Lau et Benjamin J. Cowling du Centre collaborateur de l’OMS pour les maladies infectieuses. Epidémiologie et contrôle à Hong Kong et Lin Wang de l’Université de Cambridge.
La recherche a été financée par le Health and Medical Research Fund de Hong Kong, les National Institutes of Health et les Centers for Disease Control and Prevention.
Meyers est titulaire de la chaire du centenaire Denton A. Cooley de l’Université du Texas à Austin.
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