New COVID-19 Research Provides In-Depth Information on the Transmission and Mutation Properties of SARS-CoV-2

Learn from past SARS-CoV-2 outbreaks for future pandemic control.

in the COVID-19[feminine pandémie, 57 millions de personnes ont déjà été infectées dans le monde. Dans la recherche de vaccins et de thérapies, une compréhension précise du virus, de ses mutations et de ses mécanismes de transmission est cruciale. Une étude récente du groupe de recherche du chercheur principal Andreas Bergthaler au Centre de recherche CeMM pour la médecine moléculaire de l’Académie autrichienne des sciences, dans la célèbre revue Science Translational Medicine, y apporte une contribution importante. La haute qualité des données épidémiologiques en Autriche, ainsi que le séquençage du génome viral à la pointe de la technologie, ont soutenu des connaissances sans précédent sur le comportement de mutation et la transmission du virus. SRAS-CoV-2 virus.

Le projet «Dynamique mutationnelle du SRAS-CoV-2 en Autriche» a été lancé par le CeMM en étroite coopération avec l’Université de médecine de Vienne à la fin du mois de mars. En collaboration avec l’Agence autrichienne pour la santé et la sécurité alimentaire (AGES) et en coopération avec de nombreuses universités et hôpitaux de toute l’Autriche, les scientifiques travaillent à dresser un tableau plus précis des mutations et des transmissions virales qui se produisent par séquençage du génome du SRAS-CoV- 2 virus. Sous la direction des chercheurs principaux du CeMM, Andreas Bergthaler et Christoph Bock, 750 échantillons provenant d’importants groupes d’infection par le SRAS-CoV-2 en Autriche, tels que la ville touristique d’Ischgl et de Vienne, ont été reconstruits phylogénétiquement et épidémiologiquement et leur rôle dans la propagation transcontinentale du virus a été analysé. Les résultats fournissent également des informations importantes sur la transmission et le développement de mutations dans le virus SARS-CoV-2.

Les analyses de mutation ont révélé des corrélations entre les grappes

Sur la base de données épidémiologiques, les scientifiques ont utilisé des analyses de mutation pour reconstruire un cluster SRAS-CoV-2 composé de 76 cas et pour découvrir un lien cryptique entre deux clusters épidémiologiques. «Cet exemple illustre comment la recherche des contacts et l’analyse des mutations virales constituent ensemble un pilier solide de la lutte contre la pandémie moderne», déclare le chef de projet Andreas Bergthaler. Franz Allerberger, chef de la division de santé publique d’AGES et co-auteur de l’étude, est d’accord: «Les techniques modernes de séquençage du génome viral soutiennent la recherche des contacts épidémiologiques et offrent des informations à haute résolution sur la pandémie en cours.»

Les chercheurs observent le développement de nouvelles mutations

Une particularité de l’étude est qu’une chaîne de huit transmissions consécutives a été analysée. «La chaîne de transmission a commencé avec un rapatrié d’Italie. En 24 jours, le virus SRAS-CoV-2 s’est propagé dans la grande région de Vienne via des événements publics et sociaux dans des salles fermées », disent les auteurs de l’étude CeMM, Alexandra Popa et Jakob-Wendelin Genger. La rupture précise de la chaîne de transmission a permis aux scientifiques d’observer de près le développement d’une nouvelle mutation du SRAS-CoV-2. «Grâce à d’excellentes données épidémiologiques et à nos données de séquençage approfondi du virus, nous avons pu suivre comment le virus SRAS-CoV-2 a muté chez un individu et a ensuite été transmis à d’autres», explique Andreas Bergthaler. De plus, les scientifiques ont observé le comportement de mutation du virus au cours de l’évolution de la maladie chez 31 patients. Cela peut aider à l’avenir à évaluer si les traitements influencent les caractéristiques de mutation du virus.

En moyenne, 1000 particules virales sont transmises lors d’une infection

Les résultats des analyses actuelles montrent également qu’en moyenne 1000 particules virales infectieuses sont transmises d’une personne infectée à l’autre. Ces valeurs sont globalement considérablement plus élevées que pour d’autres virus tels que le VIH ou les norovirus. Andreas Bergthaler ajoute: «Pourtant, à l’occasion, nous avons également trouvé des personnes infectées qui apparemment sont entrées en contact avec moins de particules virales et sont toujours infectées. Nous soupçonnons que des paramètres tels que l’application de mesures de protection, la voie de transmission ou le système immunitaire peuvent jouer ici un rôle décisif. Ces résultats soulèvent de nouvelles questions et hypothèses importantes. La réduction de la charge virale des personnes infectées par une combinaison de mesures telles que la protection bouche-nez, la distance physique et un échange d’air intérieur adéquat pourrait jouer un rôle clé à la fois pour empêcher la propagation du virus et peut-être même influencer l’évolution de la maladie.

L’étude actuelle, basée sur les données recueillies au cours de la phase précoce de la pandémie de SRAS-CoV-2 au printemps 2020, fournit des informations importantes sur la dynamique fondamentale des mutations du SRAS-CoV-2 chez les patients et pendant les événements de transmission. Ces résultats appuient d’autres projets de recherche en cours visant à mieux comprendre et contrôler la pandémie.

En savoir plus sur le projet: www.sarscov2-austria.org

Référence: «L’épidémiologie génomique des événements de super-propagation révèle la dynamique mutationnelle et les propriétés de transmission du SRAS-CoV-2» par Alexandra Popa, Jakob-Wendelin Genger, Michael D. Nicholson, Thomas Penz, Daniela Schmid, Stephan W. Aberle, Benedikt Agerer, Alexander Lercher, Lukas Endler, Henrique Colaço, Mark Smyth, Michael Schuster, Miguel L. Grau, Francisco Martínez-Jiménez, Oriol Pich, Wegene Borena, Erich Pawelka, Zsofia Keszei, Martin Senekowitsch, Jan Laine, Judith H.Aberle, Monika Redlberger- Fritz, Mario Karolyi, Alexander Zoufaly, Sabine Maritschnik, Martin Borkovec, Peter Hufnagl, Manfred Nairz, Günter Weiss, Michael T.Wolfinger, Dorothee von Laer, Giulio Superti-Furga, Nuria Lopez-Bigas, Elisabeth Puchhammer-Stöckl, Franz Allerberger, Franziska Michor, Christoph Bock et Andreas Bergthaler, 23 novembre 2020, Médecine translationnelle scientifique.
DOI: 10.1126 / scitranslmed.abe2555

Financement: Le projet est cofinancé par une subvention COVID-Rapid Response du Fonds pour la science et la technologie de Vienne (WWTF) et par des contributions en nature du CeMM, de l’Académie autrichienne des sciences, de l’Université médicale de Vienne et de leurs partenaires respectifs.