What we now know about the delta variant of SARS-CoV-2 wreaking havoc around the world

The Delta variant is likely to become the most dominant strain in the world. What does this mean for current and future variants?

Natural selection has shaped the evolution of all living things on our planet, including viruses. While mutations emerge in viruses, some mutations have little impact while others outweigh other variants and persist, such as SARS-CoV-2 variant, Delta – classified as variant of concern (VOC) by the World Health Organization (WHO).

Last week, Dr Poonam Khetrapal Singh, WHO Regional Director for South-East Asia, said: “The Delta variant has spread to over 100 countries and is expected to soon become the most dominant. COVID-19[feminine souche à l’échelle mondiale. Parmi les variantes préoccupantes, Delta se propage le plus rapidement.

Les chercheurs ont indiqué que la variante Delta est la variante la plus transmissible à ce jour – jusqu’à 60% plus contagieuse que la variante Alpha. Cependant, les recherches sont limitées pour déterminer si la variante Delta provoque ou non une maladie plus grave que les autres variantes.

La caractérisation des variants par l’OMS est née fin 2020 à la suite de variants présentant un risque accru pour la santé publique. Ces définitions aident à donner la priorité à la surveillance et à la recherche mondiales et, en fin de compte, à informer la réponse en cours à la pandémie de COVID-19.

Qu’est-ce qu’une variante préoccupante ?

Actuellement, la variante Delta rejoint trois autres variantes de cette catégorie : Alpha, qui a été détectée pour la première fois au Royaume-Uni en septembre 2020 ; Beta, le premier échantillon documenté enregistré en Afrique du Sud en mai 2020 ; et Gamma, dont les échantillons ont été documentés pour la première fois au Brésil en novembre 2020.

Pour être désigné comme un COV, un variant doit répondre à la définition d’un variant d’intérêt (VOI).

Cela comprend une variante :

• avec des modifications génétiques qui sont prédites ou connues pour affecter les caractéristiques du virus telles que la transmissibilité, la gravité de la maladie, l’échappement immunitaire, l’échappement diagnostique ou thérapeutique ; ET
• identifié comme provoquant une transmission communautaire importante ou plusieurs grappes de COVID-19, dans plusieurs pays avec une prévalence relative croissante parallèlement à un nombre croissant de cas au fil du temps, ou d’autres impacts épidémiologiques apparents suggérant un risque émergent pour la santé publique mondiale.

Les variantes actuellement désignées incluent Eta, Iota, Kappa et Lambda.

Pour être « promu » en COV, le variant doit avoir démontré qu’il est associé à un ou plusieurs des changements suivants à un degré d’importance pour la santé publique mondiale :

• Augmentation de la transmissibilité ou changement préjudiciable dans l’épidémiologie du COVID-19 ; OU ALORS
• Augmentation de la virulence ou modification de la présentation clinique de la maladie ; OU ALORS
• Diminution de l’efficacité des mesures de santé publique et sociales ou des diagnostics, vaccins, thérapeutiques disponibles.

Delta va-t-il supplanter les autres variantes préoccupantes ?

Alors que la variante Delta continue de se répandre dans le monde, où cela laisse-t-il d’autres variantes préoccupantes telles que Alpha, Beta et Gamma ? Delta finira-t-il par surpasser les autres ?

Le Dr Francesca Di Giallonardo, virologue au Kirby Institute de l’UNSW Sydney, suggère que cela pourrait être le cas.

“Très probablement oui, car il s’agit d’un processus courant dans la sélection naturelle et l’évasion immunitaire. Cependant, le calendrier et les caractéristiques du remplacement des variantes peuvent varier entre les différentes régions géographiques, en particulier dans celles isolées par la fermeture des frontières.

« La prédiction de l’infectiosité de nouveaux variants n’est pas anodine. En général, les virus augmentent leur transmissibilité. Cela signifie que la variante la plus «réussie en transmission» l’emporte sur les autres variantes. Cependant, il est presque impossible de prédire quelle variante remportera la course et quand nous aurons atteint le point le plus transmissible », a déclaré le Dr Di Giallonardo.

Selon le Dr Di Giallonardo, l’augmentation de la capacité virale est caractérisée par des événements de sélection naturelle. Cela signifie que si la variante B a remplacé la variante A, elle doit être plus en forme par définition, car B a supplanté A. Très probablement, la variante B est antigéniquement distincte, ce qui signifie qu’elle a échappé à la pression immunitaire.

“De telles variantes continueront d’émerger à mesure que la sélection immunitaire augmente en raison du nombre accru de personnes vaccinées ou infectées”, a déclaré le Dr Di Giallonardo.

Les variantes plus aptes sont-elles susceptibles de provoquer une maladie grave ?

Si une variante l’emporte sur d’autres variantes, cela suggère-t-il qu’il peut provoquer une maladie plus grave chez l’homme ou n’est-ce pas le cas ? Le Dr Di Giallonardo a déclaré que cette hypothèse n’était pas nécessairement correcte.

« Les nouvelles variantes sont plus adaptées, de sorte que leur capacité de réplication et de transmission est meilleure par rapport aux variantes précédentes. Il existe de nombreuses variantes émergentes qui sont spécifiques à une région et ne provoquent apparemment pas de maladie plus grave.

“Cependant, une surveillance constante de ces variantes est cruciale pour identifier celles qui causent effectivement une maladie plus grave. Ainsi, l’OMS et les CDC (Centres de contrôle et de prévention des maladies) classent les nouvelles variantes émergentes avec un potentiel de gravité accrue comme variantes préoccupantes et variantes d’intérêt.

Quelle est notre meilleure ligne de défense ?

« Vacciner, vacciner et vacciner », a déclaré le Dr Di Giallonardo. « Nous avons une pléthore de données mondiales sur l’efficacité des différents vaccins. Nous savons à quel point ils sont efficaces pour prévenir les maladies graves et réduire la transmission. »

La virologue, le Dr Chantelle Ahlenstiel de l’Institut Kirby, a déclaré qu’en ce qui concerne les vaccins à ARNm tels que Pfizer et Moderna, les séquences des vaccins actuels – qui indiquent au corps comment fabriquer un type spécifique de protéine de pointe virale – peuvent être facilement modifiées en correspondent à la protéine de pointe de variante virale nouvellement émergente et pourraient donc également fournir une protection contre celles-ci. De plus, les vaccins à ARNm peuvent être fabriqués rapidement et à moindre coût.

La surveillance est également essentielle pour comprendre quelles variantes circulent, car une identification précoce permettra une évaluation rapide de l’efficacité du vaccin.

« La surveillance signifie la collecte de données sur le nombre d’infections présentes pour différentes variantes de virus, leur propagation géographique et la gravité de la maladie associée. Ces données sont essentielles pour mieux comprendre comment les variantes se propagent à travers les États, le pays et le monde. Nous avons plus de données pour Covid-19 que pour toute autre maladie virale, grâce à des systèmes déjà en place tels que nexstrain.org, GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) », a déclaré le Dr Di Giallonardo.

« La surveillance nécessite une énorme quantité de travail et les efforts mondiaux ont été formidables. »