La résistance aux antibiotiques se répand en Europe

La résistance aux antimicrobiens (RAM) a augmenté de 32% depuis 2007 en Europe, selon un tout nouveau rapport.

Un nouveau rapport Lancet basé sur les données fournies par EARS-Net en 2015 dénombre 33 000 décès dus à la RAM, dont 39% sont dus à des infections par des bactéries résistantes aux antibiotiques de dernière ligne tels que les carbapénèmes et la colistine. Selon les estimations des Centres européens de contrôle et de prévention des maladies (ECDC), 25 100 décès liés à la RAM ont été enregistrés en 2007.

Les auteurs de l'étude affirment que le fardeau de ces infections est comparable à celui de la grippe, de la tuberculose et du VIH / sida combinés, mais que la contribution de diverses bactéries résistantes aux antibiotiques à la charge globale varie considérablement d'un pays à l'autre. Selon cette étude, 75% du fardeau de la maladie est dû à des infections badociées aux soins de santé (IAS).

Cependant, le problème ne semble pas se limiter aux infections nosocomiales. Des chercheurs de l'institut Julius Kühn, en Allemagne, ont rapporté dans mBIO que les fruits et légumes sont un réservoir de gènes transférables de résistance aux antibiotiques qui échappent souvent aux méthodes de détection moléculaire traditionnelles. Ces gènes de résistance aux antibiotiques pourraient échapper aux méthodes de détection indépendantes de la culture, telles que la PCR, mais pourraient tout de même être transférés à des agents pathogènes humains ou à des agents commensaux.

L'équipe a mélangé 24 échantillons de salade, de roquette et de coriandre achetés dans des supermarchés allemands pour badyser les gènes de résistance aux antibiotiques transférables chez les bactéries par culture et à l'aide de méthodes basées sur l'ADN. Bien qu'initialement faibles, des E. coli résistants au TET ont été isolés de tous les échantillons de produits achetés après un enrichissement non sélectif. Les isolats d'E. Coli résistants au TET ont été principalement isolés à partir de coriandre, suivis d'un mélange de salade prête à manger et de roquette. Ils ont en outre démontré que les plasmides de multirésistance aux médicaments étaient transférables aux récepteurs sensibles à E. coli, processus susceptible de se produire dans les intestins humains.

Presque tous les isolats d'E. Coli étaient résistants aux antibiotiques d'au moins une clbade et deux isolats étaient résistants à huit clbades; tétracyclines, pénicillines, céphalosporines de troisième génération, fluoroquinolones, aminoglycosides, sulfamides, phénicols et triméthoprime. Aujourd'hui, aucun système de PCR en temps réel (RT-PCR) permettant la détection et la quantification indépendantes de la culture de ces plasmides dans l'ADN communautaire total n'est disponible.

L'étude a montré que les bactéries badociées aux fruits et légumes peuvent contenir divers plasmides qui pourraient représenter un lien important entre les microbiomes de l'intestin et de l'environnement. Les chercheurs ont déclaré que ces bactéries devraient être considérées comme une voie importante de dissémination des résistances aux antibiotiques transférables, qui pourraient être pertinentes pour les patients sous traitement antibiotique.

Les efforts internationaux de lutte contre la RAM, tels que le projet IMI ENABLE, ont été intensifiés cette année. Lors du récent Sommet mondial de la santé tenu à Berlin, la ministre allemande de la Recherche, Anja Karliczek, a annoncé des investissements de 40 millions d'euros pour le CARB-X et de 50 millions d'euros pour le GARPD. Les progrès réalisés sur le terrain et les derniers développements en matière de diagnostic et de traitement de la RAM seront mis en évidence par les développeurs, les décideurs, les régulateurs et les experts en propriété intellectuelle lors de la 12ème Conférence de Berlin sur les sciences de la vie.